Сюжет картины продолжает описывать события, происходящие с членами могущественного клана Корлеоне. Действие происходит в 1979 году, когда во главе семейства стоит Майкл Корлеоне.

Времена меняются, и Майкл решает, что пришла пора легализовать свой бизнес. Семья начинает сотрудничать с влиятельными силами из Ватикана и заниматься благотворительностью. Но за внешней респектабельностью не скроешь свое истинное лицо. Старые дела группировки, то и дело дают о себе знать. Майкл подыскивает себе достойного преемника, и, кажется, находит его в лице сына погибшего брата Санни.

Между тем, нарастают интриги и внутренняя борьба внутри клана – когда-то преданные и близкие люди, в борьбе за сферы влияния готовы стать предателями и врагами. Крестному отцу Майклу Корлеоне приходится вспомнить старые, испытанные методы борьбы с противником, но за свои кровавые деяния ему придется расплатиться самой дорогой ценой.